中药学论文_基于数据挖掘和网络药理学的冠心病
文章目录
1 资料与方法
1.1 病案收集
1.2 纳入标准
1.3 排除标准
1.4 数据处理
1.5 数据挖掘
1.6 中药活性成分及其靶基因筛选
1.7 疾病靶基因筛选
1.8 蛋白互作网络图的构建与潜在蛋白质功能模块分析
1.9 GO与KEGG富集分析
2 结 果
2.1 频次统计
2.2 证素中药筛选
2.3 中药活性成分及其靶基因筛选
2.4 疾病靶基因筛选
2.5 蛋白互作网络图构建与潜在蛋白质功能模块分析
2.6 GO与KEGG富集分析
3 讨 论
文章摘要:目的:对冠心病中医病案进行用药规律的挖掘分析,运用网络药理学阐释作用机制。方法:运用Excel表格及Python软件将中国知网、万方数据及维普中文科技期刊数据库中收集的343例冠心病临床病案的证素以及用药进行频数统计、权值计算,获得核心中药。通过检索TCMSP、UniProt、TTD、Genecards、OMIM、DRUGEBANK等数据库,获得核心药物的活性成分、潜在作用靶点及冠心病相关的作用靶点。将药物与疾病的交集基因导入STRING平台构建PPI网络图,运用Cytoscape 3.9.0对图形进行修改并运用插件MCODE分析潜在蛋白质功能模块。将交集基因导入DAVID平台进行GO与KEGG富集分析,运用R语言对结果进行可视化展示。结果:通过数据挖掘发现治疗冠心病的潜在药对"丹参-郁金"。网络药理学分析发现,"丹参-郁金"包含柚皮素、隐丹参酮、黄芩苷、β-谷甾醇、木犀草素等在内的20个主要化合物和148个潜在靶基因,与筛选的4027个冠心病靶基因共有120个交集基因。对120个交集基因的GO富集分析发现566个生物进程,71个细胞组分,80个分子功能,KEGG富集分析得到108条信号通路。结论:"丹参-郁金"主要通过调控PI3K-Akt、HIF-1、FoxO、TNF、NF-κB和MAPK等信号通路诱导的炎症反应、细胞凋亡、细胞增殖、氧化应激等病理过程对冠心病起到治疗作用。
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